물론 가능합니다. 다만 이건 만들때 초기부터 염두를 하고 제작해야 합니다.
스위치를 사용해서 가능하며, 스테이지와 스테이지 구간의 구별을 스위치로 놓아야 특별한 버그가 없습니
다.

무슨말인고 하니,

스테이지2에서는 전체적인 이벤트에서 스위치 "스테이지 2"가 필요하다면,

올클리어데이터에서 스위치 "스테이지 2"를 ON시켜 중간부터 끊어서 하면 된다는 것이죠.
물론 스테이지 2를 한다면 그에 알맞는 주인공의 능력치를 설정해 주어야겠구요 이런식으로 하면 스테이지2만 진행되며, 스테이지 1이나 3은 당연히 불가능하겟죠?
이런 시스템은 스토리가 긴편에 자주 쓰는것도 괜찮을것 같네요 ^^