유틸의 이름을 제대로 알려주지 않으셔서 추측으로 답변을 적습니다.
아마도 말씀하신 유틸은 "캐릭터 메이커"라고 생각됩니다. 정해진 포맷으로 손 쉽게 필드용 캐릭칩을
만들어주는 유틸이죠. 사용방법이 좀 까다롭지만...
제가 봤을 때 색이 깨지는 건, 어쩔 수 없는 문제라고 생각됩니다. PNG 포맷으로 저장이 될 경우에,
사용할 수 있는 색이 상당히 제한되어져 버립니다. 그래서 PNG 포맷의 파일은 용량이 적죠. PNG 파일을
수정하시려면, "캐릭터 레이더"라는 프로그램을 사용하시는 것이 좋습니다. 캐릭터 레이더로 BMP 파일로
"다른 이름으로 저장"을 하면 포토샵으로 수정이 가능할지도 모르겠네요.
참고로, 캐릭칩을 그리시려면 "캐릭터 레이더"가 편합니다. 도트찍기도 편하고, RPG2K의 경우
24*32의 사이즈로 캐릭칩 선택해서 애니메이션까지 시뮬레이션 해 볼수도 있기 때문에 편리하죠. ^^
특별한 이유가 없다면, 캐릭터 레이더의 사용법을 익히셔서 그것을 사용하시기 바랍니다.
추가로, 게임을 완성하면 폴더에 아무것도 없다는 말은 이해할 수가 없습니다. 어느 폴더에 파일이 하나도
없다는 것인지... "런타임 패키지"를 말씀하시는 거라면, "게임 디스크 만들기"를 선택한 다음에 파일
압축할 때 "런타임 패키지 포함"이라고 쓰여진 곳에 체크를 하면 런타임 패키지 파일들까지 전부 복사를
하므로 참고하시기 바랍니다.