http://www.theolized.com/2014/09/rpg-maker-window-too-big-how-do-we-fix.html
이게 참고가 될지 모르겠습니다.

“Verdana“라는 폰트가 있는지 확인해보라고 합니다. 그리고 공식 포럼에 질문을 올릴 경우 해적으로 몰릴 수 있으니 주의하라고 합니다. (http://forums.rpgmakerweb.com/index.php?/topic/32392-program-window-size/)

Pawn님의 스크린샷과 위의 주소의 스크린샷은 조금 다르지만 그래도 폰트 문제를 확인해보는게 좋을 것 같습니다.